Trong bộ phim Là Thần Trong Thế Giới Vô Thần, Yukito - con trai của những người đứng đầu một giáo phái, sau khi cha mẹ anh hy sinh đã được tái sinh vào một thế giới khác. Tuy nơi đây không tồn tại tôn giáo nhưng lại rất nhiều cuốn sách khiêu dâm, trở thành những bức vẽ ngây thơ của trẻ con. Yukito sẽ phải đối diện với những thách thức mới, khám phá và thí nghiệm để hiểu rõ hơn về bản chất con người và ý nghĩa của cuộc sống trong một thế giới không có thần linh.