Bước chạy thanh xuân xoay quanh cuộc hành trình của Kakeru Kurahara, một sinh viên năm nhất đại học được thúc đẩy bởi Haiji Kiyose để tham gia cuộc đua Hakone Ekiden. Dưới sự dẫn dắt của Haiji, Kakeru và những người bạn khác đã cùng nhau tập luyện, cạnh tranh và vượt qua những thử thách để hoàn thành cuộc đua quan trọng này. Qua việc chinh phục bản thân và hợp tác, họ không chỉ hiểu rõ hơn về ý nghĩa của việc chạy bộ mà còn giúp đỡ lẫn nhau vượt qua khó khăn trong cuộc sống hàng ngày.